Aby zbadać tę hipotezę, przetestowaliśmy powiązanie między polimorfizmami pojedynczych nukleotydów (SNP) w MMP12 i miarą czynności płuc (wymuszona objętość wydechowa w ciągu sekundy [FEV1]) w siedmiu kohortach, w tym uczestnicy dwóch badań dzieci z astmą, uczestnikami badania kohortowego z narodzinami i czterema kohortami, które obejmowały dorosłych z POChP i dorosłych bez POChP. Metody
Projekt badania
Szczegółowy opis metod badania można znaleźć w Dodatku uzupełniającym, dostępnym wraz z pełnym tekstem tego artykułu na stronie. Protokoły rekrutacji uczestników i gromadzenia danych w Genetyka Astmy w Kostaryce (GACRS), Program Zarządzania Astmą w Dzieciństwie (CAMP, ClinicalTrials.gov numer, NCT00000575), Dzieci, Alergia, Środowisko, Sztokholm, Badania epidemiologiczne (BAMSE), badanie Boston Early-Onset COPD (eoCOPD), National Emphysema Treatment Trial (NETT, NCT00000606), Lovelace Cohort Cohort (Lovelace) oraz badanie normatywnego starzenia się (NAS) zostały opisane wcześniej. -16 Spirometria została przeprowadzona zgodnie z zaleceniami American Thoracic Society17. Wszystkie badania zostały zatwierdzone przez komisję do spraw instytucji lub komisji etycznej. Wszyscy dorośli uczestnicy i rodzice dzieci, którzy wzięli udział, wyrazili pisemną zgodę, a nieletni, którzy byli w stanie to zrobić, wyrazili zgodę.
Genotypowanie
W GACRS genotypowane markery zostały wybrane przy użyciu algorytmu tagowania wiązania i nierównowagi dla MMP12 i jego boków 10 kb w triach Centre d Etude du Polymorphisme Humain (CEPH) w HapMap. Te same SNP, które genotypowano w kohorcie GACRS, genotypowano w kohorcie CAMP w celu porównania wzorców łączenia i nierównowagi pomiędzy tymi kohortami. Dwa SNP, które wykazały znaczące asocjacje w kohorcie GACRS (rs737693 i rs2276109) zostały genotypowane w kohortach eoCOPD, NETT i NAS; jeden z tych SNP (rs2276109) został genotypowany w kohortach BAMSE i Lovelace.
Aby ustalić, czy nasze odkrycia można wyjaśnić przez brak sprzężenia między wariantami w MMP12 i tymi w sąsiadującej metalowej macierzy kodującej metaloproteina-zę 3 (MMP3), genotypowaliśmy cztery SNP w MMP3 w kohorcie GACRS.
Analiza statystyczna
We wszystkich kohortach prewalverodilator FEV1 (zwany dalej FEV1) analizowano jako zmienną ciągłą. Zdefiniowaliśmy COPD według zmodyfikowanych kryteriów II etapu Globalnej Inicjatywy na Przewlekłą Obturacyjną Chorobę Płuc.9 Przeanalizowaliśmy czas wystąpienia POChP w kohorcie NAS i samej POChP w kohorty eoCOPD i Lovelace. Wszystkie analizy zostały dostosowane do wieku, płci, wzrostu i ekspozycji na dym.
Przeprowadziliśmy analizy asocjacyjne oparte na rodzinach FEV1, POChP lub obu w kohorty GACRS i eoCOPD przy użyciu statystyki opartej na rodzinnej asocjacji (FBAT) zaimplementowanej w oprogramowaniu PBAT, wersja 3.6,18 i analizy regresji liniowej FEV1 w kohorty BAMSE, NETT i Lovelace z wykorzystaniem oprogramowania SAS, wersja 9.1.2 (SAS Institute). Rodzinną analizę asocjacyjną wielokrotnych pomiarów FEV1 w kohorcie CAMP przeprowadzono przy użyciu podejścia FBAT-Principal Components (PC) 19. W kohorcie NAS wykonaliśmy analizy podłużne FEV1 przy użyciu uogólnionych modeli mieszanych liniowo i analiza przeżycia POChP za pomocą modeli proporcjonalnego hazardu Coxa
[podobne: wzorcowanie przyrządów pomiarowych, hurtownia torebek, promazyna ]
Powiązane tematy z artykułem: hurtownia torebek promazyna wzorcowanie przyrządów pomiarowych